Chùa tọa lạc dưới chân núi Kỳ Lân, bên dòng Kênh Vi, cảnh đẹp nơi đây đã làm đắm say biết bao tao nhân mặc khách đến với miền đất và con người xứ Thanh. Chùa được vua Lê Thần Tông khởi dựng và vua Lê Huyền Tông xây dựng lại vào cuối năm Cảnh Trị thứ 9 (1671) làm nơi thờ vua Thần Tông, Hoàng hậu cùng các phi tần của ngài. Chùa được tu sửa tôn tạo nhiều lần vào các triều đại Lê và Nguyễn về sau, nhưng đã bị phá hủy trong chiến tranh chống Mỹ, đến năm 2000 được nhà chùa cùng nhân dân, các Phật tử tôn tạo lại một cách bề thế như hiện nay. Núi Kỳ Lân là một trong những danh sơn nổi tiếng, nơi các tao nhân mặc khách, các vị vua chúa xưa đã từng đến đây vãn cảnh, đề thơ. Núi Kỳ Lân và chùa Đại Bi còn là di tích cách mạng, nơi tập hợp lực lượng phong trào yêu nước và đấu tranh cách mạng của nhân dân thị xã Thanh Hóa, có vai trò quan trọng trong kháng chiến chống Pháp và chống Mỹ. Di tích hiện còn lưu giữ được nhiều hiện vật có giá trị đặc biệt về lịch sử văn hóa như tượng Lê Thần Tông và các hoành phi có niên đại thế kỷ XVII, giếng chùa với nhiều chạm khắc của thế kỷ XVII... Sau 2 năm, nhờ công sức của các phật tử, nhiều nhà hảo tâm trong tỉnh, trong nước và nước ngoài đã cung tiến tài lực, vật lực để tôn tạo, dựng lại ngôi chùa một cách khá bề thế, khang trang. Đây là trụ sở của Giáo hội Phật giáo thành phố Thanh Hóa, là điểm đến tâm linh hấp dẫn không riêng chỉ các Phật tử mà còn của du khách bốn phương.